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FACULTÉ DE MÉDECINE
PIERRE ET MARIE CURIE
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Unix/Linux : informatique pour la Biologie (OBI1)

Résumé

Type de certification

  • Formation qualifiante

Thématique

  • Bioinformatique et statistiques

Composante(s)

Présentation

Code FC

  • B138

Objectifs

Le stagiaire s’initiera au traitement de l'information en biologie par l'utilisation du système Unix/Linux. Le stagiaire sera mis en situation d'utiliser des logiciels du domaine public et universitaire développés en biologie et bio-informatique, et de les interfacer de manière professionnelle grâce aux outils Unix.

Contenu

  • UNIX/Linux : le système Unix, les environnements et leurs configurations (personnalisation), les outils UNIX.
  • Programmation système Unix : programmation de scripts bash, interpréteurs awk, application à l'enchaînement et à l'interfaçage de logiciels du domaine public et universitaire.
  • Les expressions régulières : définition et utilisation dans le traitement de l'information biologique (awk, grep, sed). Application au traitement des entrées/sorties des logiciels.

Pour en savoir plus : http://abiens.snv.jussieu.fr/OBI/OBI1

 

Niveau d'études visé

  • Inconnu

Effectif minimal

  • 1

Effectif maximal

  • 4

Public cible et prérequis

Public et prérequis

Biologistes (au sens large), chercheurs, ingénieurs ou techniciens.

Pré requis : avoir une expérience minimale du travail sur ordinateur (bureautique par exemple)

Tarifs

Tarifs

1 100 €.

Organisation/Calendrier

Organisation

Durée de la formation : 28 h sur 8 demi-journées
(4 jours successifs).

Nombre de Participants : minimum 1 - maximum 4.

Le public sera composé des stagiaires en formation continue et doctorants (maximum 14 personnes au total).

Les travaux pratiques sont encadrés par au moins deux enseignants.

Calendrier

Du 5 au 8 mars 2018
Inscription obligatoire au moins 2 mois avant la session.

Durée

  • 28 heures sur 8 demi-journées (4 jours successifs)

Lieu(x)

  • Campus Jussieu

Contacts/Inscription

Responsable

  • Lafontaine Ingrid
  • Lopez Philippe

Inscription

Contact administratif

Pôle sciences - Corinne Vidal – 01 44 27 82 82
email : formation.continue @ upmc.fr
Accueil : campus Jussieu - tour 14 - couloir 14/24 – 5e étage 4, place Jussieu - 75252 Paris cedex 05 - Métro Jussieu

Evaluation/Validation

Validation

  • Attestation de fin de formation