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FACULTÉ DE MÉDECINE
PIERRE ET MARIE CURIE
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Bases algorithmiques et statistiques de l'analyse des séquences - Applications avec les logiciels disponibles en ligne (OBII3)

Résumé

Type de certification

  • Formation qualifiante

Thématique

  • Bioinformatique et statistiques

Composante(s)

Présentation

Code FC

  • B131

Objectifs

Le stagiaire comprendra les méthodes et les algorithmes utilisés en génomique et en analyse de séquences. Il se familiarisera avec l’utilisation des outils bioinformatiques disponibles en ligne. L’accent sera mis sur l’utilisation raisonnée des logiciels afin d’amener le stagiaire à avoir une analyse critique des résultats.

Contenu

  • Alignements 2 à 2 (NWS, Smith&Waterman).
  • Alignement globaux, alignements par blocs.
  • Scores d'alignements.
  • Validation statistique.
  • Banque de données.
  • Algorithmes de recherche de similarités dans les banques (algorithmes de FASTA, BLAST, SSEARCH).
  • Détermination des motifs - recherche de motifs sur les séquences ou sur les banques - Application à la localisation de zones codantes.

Effectif maximal

  • 14

Public cible et prérequis

Public et prérequis

Biologistes (au sens large), chercheurs, ingénieurs ou techniciens.

Prérequis :

  • Avoir des connaissances de base en biologie moléculaire.
  • Avoir l’habitude du travail sur ordinateur et de l’utilisation Internet.

Tarifs

Tarifs

720 €

Organisation/Calendrier

Organisation

Le public sera composé des stagiaires en formation continue et doctorants.
Les travaux pratiques sont encadrés par au moins deux enseignants.

Calendrier

Du 17 au 20 avril 2017
Inscription obligatoire au moins 2 mois avant la session.

Durée

  • 28 h sur 8 demi-journées (4 jours successifs)

Contacts/Inscription

Responsable

  • Lafontaine Ingrid
  • Lopez Philippe

Inscription

Contact administratif
Pôle sciences - Corinne Vidal - 01 44 27 82 82
formation.continue @ upmc.fr
Accueil : campus Jussieu – tour 14 – couloir 14/24 – 5e étage
4, place Jussieu – 75252 Paris cedex 05 – Métro Jussieu

Evaluation/Validation

Validation

  • Attestation de fin de formation